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もぐりん様
もう一度
chmod 755 /usr/share/texmf/ls-R
とコマンドを打ちましたが

/var/spool/texmf/ls-R:Permission denied
が消えませんでした。
どうすればよいでしょうか？

> /var/spool/texmf/ls-R:Permission denied
> が消えませんでした。
> どうすればよいでしょうか？

それでは、
chmod 755 /var/spool/texmf/ls-R
としたらどうですか？

ひとまず

[ファイル名]:permission denied

とでたら、

chmod 755 [ファイル名]

としていってください。

/var/spool/texmf/ls-R:Permission denied
だったら、「/var/spool/texmf/ls-R」が[ファイル名]になります。

....って、これくらいの応用、できませんかねぇ？
Cygwinで何をしようとしているかは存じませんが、もう少しCygwinやunixについての勉強をする事をお勧めします。

おかげさまで出来ました。
ありがとうございました。