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環境変数PATHに、
C:\WINDOWS\system32
を追加した結果以下の表示がまだ消えないのでどうすれば良いでしょうか？

ディレクトリが空ではありません。
startxwin.bat - Startting on Windows NT/2000/XP/2003

環境変数のTMPまたはTEMPの設定はされていますか？
またHDDの空き容量は？

ＴＭＰ　はc:\tmpです。

startxwin.batの

REM
REM Cleanup after last run.
REM

if not exist %CYGWIN_ROOT%\tmp\.X11-unix\X0 goto CLEANUP-FINISH
attrib -s %CYGWIN_ROOT%\tmp\.X11-unix\X0
del %CYGWIN_ROOT%\tmp\.X11-unix\X0

:CLEANUP-FINISH
if exist %CYGWIN_ROOT%\tmp\.X11-unix rmdir %CYGWIN_ROOT%\tmp\.X11-unix

を見て，何が問題か，何をすべきか
考えてみればよいと思います。