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└◇2956:Re:emacsで日本語入力 [nil] 06/19 18:16

>Can't activate input method japanese
これは、emacs からのメッセージですよね。

単に、X の設定はやってみたが、emacs の設定に関しては、何が必要か確認(?)が不十分な状態なのではないでしょうか?

emacs を端末上で使いたいのか、X11 上で使いたいのか、推測できないのですが(私は Meadow利用で、Cygwin Xは不使用なので)、Meadowを使うにしても、ある程度は emacs の設定の知識が必要で、Cygwin との組み合わせであれば、不整合を埋めるそれなりの工夫が必要です。
いずれにせよ、emacs に関しての調査が必要でしょう。