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pTexをインストールした際にPATHの設定をスレッド一覧
したはず。それでCygwinを使っているときも
Texのフォントなんかを捜すのにpTexをインストール
したディレクトリを見にいってしまうのでしょう。
とりあえず、pTexインストール時におこなった
設定を、バックアップを取ってから、
もとにもどし、lilypond関係を(Texも含めて)
reinstallしてやるとちゃんと動くと思われます。
本当は、CygwinのTexとpTexを上手に共存させるのが
ベストだとおもいますが、それはあっしには、にはか
にはわからんです。
誰かレスしてくんないかな?
正確には、PATHというよりスレッド一覧
set TEXMFMAIN=C:/usr/local/share/texmf
set TEXMFCNF=C:/usr/local/share/texmf/web2c
という設定ですね。
(これは私のWin98のAutoexec.batのものです。)
これをチャラにしてからinstallしなおすと
うまくいくように思います。