追試してみました。
環境は、Windows 2000 Professional SP4 で、これまで Cygwin を入れたことがないもの。VMware 4.5.2 上の環境です。
setup.exe を実行し、gtk2-x11 を選んでインストールを続行すると、おっしゃるとおりのダイアログが出ます。Pathがおかしいのも同じ。
で、再度まっさらな環境で(VMwareでCygwinをインストールする前に戻した)、
マイコンピュータ→プロパティ→詳細→環境変数で、システム環境変数 Path の先頭に c:\cygwin\bin;c:\cygwin\usr\X11R6\bin を追加してから、
再度 setup.exe を起動し、gtk-x11 を選んで、作業を進めると……エラーは出ませんでした。
参考になればよいのですが。
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