> makeコマンドが、実行されません。
bash: make: command not found というエラーでしょうか？
大事なことなので、最初のご質問の時点で明らかにされる方が良いと思います。
> たぶんインストール自体がうまくいっていないと思うのですが、makeやgccはどのようなパッケージに含まれているのでしょうか？
Cygwin setupのSelectPackagesのウィンドウでDevelツリーを開けば見つかると思います。
これらは、Defaultではinstallされないはずなので、手動でInstallを選択してから「次へ>」を押してください。
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